哪吒在陳塘關過著平靜生活，直到體內靈珠突然暴走，揭示出他并非簡單的魔丸轉世，而是被刻意調換的靈珠載體，隱藏著更深的秘密。哪吒在追尋真相過程中遇到自稱"靈族"后裔的少女碧瑤，她掌握著與哪吒同源的靈力，兩人共同揭開千年前靈族被天庭剿滅的歷史。